- O que é transcrição de DNA?
- Transcrição em eucariotos (processo)
- - Como são os genes eucarióticos?
- - Quem é o responsável pela transcrição?
- - Qual é o processo?
- Iniciação
- Alongamento
- Terminação
- Transcrição em procariontes (processo)
- - Como são os genes procarióticos?
- - Como é a RNA polimerase procariótica?
- - Qual é o processo?
- Iniciação
- Alongamento
- Terminação
- Referências
A transcrição do DNA é o processo pelo qual as informações contidas no ácido desoxirribonucléico são copiadas como uma molécula semelhante, o RNA, seja como uma etapa para a síntese de proteínas ou para a formação de moléculas de RNA envolvidas na múltiplos processos celulares de grande importância (regulação da expressão gênica, sinalização, etc.).
Embora não seja verdade que todos os genes de um organismo codifiquem proteínas, é verdade que todas as proteínas de uma célula, sejam eucarióticas ou procarióticas, são codificadas por um ou mais genes, onde cada aminoácido é representado por um conjunto de três bases de DNA (códon).
Processamento de genes eucarióticos (Fonte: Leonid 2 / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0) via Wikimedia Commons)
A síntese da cadeia polipeptídica pertencente a qualquer proteína celular ocorre graças a dois processos fundamentais: transcrição e tradução; ambos altamente regulados, pois são dois processos de grande importância para o funcionamento de qualquer organismo vivo.
O que é transcrição de DNA?
A transcrição envolve a formação de um "molde" para uma molécula de RNA conhecida como "RNA mensageiro" (mRNA) a partir da sequência "padrão" codificada na região do DNA correspondente ao gene a ser transcrito.
Esse processo é realizado por uma enzima chamada RNA polimerase, que reconhece lugares especiais na sequência de DNA, se liga a eles, abre a fita de DNA e sintetiza uma molécula de RNA usando uma dessas fitas complementares de DNA como molde ou padrão, mesmo quando encontra outra sequência de parada especial.
A tradução, por outro lado, é o processo pelo qual ocorre a síntese de proteínas. Consiste na "leitura" da informação contida no mRNA que foi transcrito de um gene, na "tradução" dos códons do DNA em aminoácidos e na formação de uma cadeia polipeptídica.
A tradução das sequências de nucleotídeos do mRNA é realizada por enzimas conhecidas como aminoacil-tRNA sintetases, graças à participação de outras moléculas de RNA conhecidas como "RNA de transferência" (tRNA), que são anticódons dos códons contidos no MRNA, que são uma cópia fiel da sequência de DNA de um gene.
Transcrição em eucariotos (processo)
Durante a transcrição em eucariotos, o DNA é usado como molde para criar uma fita de RNA mensageiro com a ajuda da enzima RNA polimerase.
Nas células eucarióticas, o processo de transcrição ocorre dentro do núcleo, que é a principal organela intracelular onde o DNA está contido na forma de cromossomos. Ele começa com a "cópia" da região codificadora do gene que é transcrita em uma molécula de banda única conhecida como RNA mensageiro (mRNA).
Uma vez que o DNA está confinado na referida organela, as moléculas de mRNA funcionam como intermediários ou transportadores na transmissão da mensagem genética do núcleo para o citosol, onde ocorre a tradução do RNA e toda a maquinaria biossintética para a síntese de proteínas (o ribossomos).
- Como são os genes eucarióticos?
Um gene consiste em uma sequência de DNA cujas características determinam sua função, uma vez que a ordem dos nucleotídeos nessa sequência é o que determina sua transcrição e posterior tradução (no caso daqueles que codificam para proteínas).
Quando um gene é transcrito, ou seja, quando sua informação é copiada na forma de RNA, o resultado pode ser um RNA não codificador (cRNA), que tem funções diretas na regulação da expressão gênica, na sinalização celular, etc. ou pode ser um RNA mensageiro (mRNA), que será então traduzido em uma sequência de aminoácidos em um peptídeo.
Representação da estrutura de um gene eucariótico (Fonte: Thomas Shafee / CC BY (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0) via Wikimedia Commons)
Se um gene tem um produto funcional na forma de RNA ou proteína depende de certos elementos ou regiões presentes em sua sequência.
Genes, eucarióticos ou procarióticos, têm duas fitas de DNA, uma conhecida como fita "sentido" e a outra "anti-sentido". As enzimas responsáveis pela transcrição dessas sequências "lêem" apenas uma das duas fitas, normalmente a fita "sentido" ou "codificadora", que tem uma "direção" 5'-3 '.
Cada gene tem sequências regulatórias em suas extremidades:
- se as sequências forem anteriores à região codificadora (aquela que será transcrita), são conhecidas como "promotores"
- se estiverem separados por muitos quilobases, podem estar "silenciando" ou "intensificando"
- aquelas sequências que estão mais próximas da região 3 'dos genes são geralmente sequências terminadoras, que dizem à polimerase que ela deve parar e terminar a transcrição (ou replicação, conforme o caso)
A região promotora é dividida em distal e proximal, de acordo com sua proximidade com a região codificadora. É na extremidade 5 'do gene e é o local que a enzima RNA polimerase e outras proteínas reconhecem para iniciar a transcrição de DNA para RNA.
Na parte proximal da região promotora podem ligar-se fatores de transcrição, os quais têm a capacidade de modificar a afinidade da enzima para a sequência a ser transcrita, sendo assim responsáveis por regular positiva ou negativamente a transcrição dos genes.
As regiões estimuladoras e silenciadoras também são responsáveis pela regulação da transcrição do gene, modificando a "atividade" das regiões promotoras pela sua ligação com elementos ativadores ou repressores "a montante" da sequência de codificação do gene.
Diz-se que os genes eucarióticos estão sempre "desligados" ou "reprimidos" por padrão, portanto, eles precisam ser ativados por elementos promotores para serem expressos (transcritos).
- Quem é o responsável pela transcrição?
Seja qual for o organismo, a transcrição é realizada por um grupo de enzimas chamadas RNA polimerases, que, assim como as enzimas responsáveis pela replicação do DNA quando uma célula está prestes a se dividir, se especializam na síntese de uma cadeia de RNA de uma das fitas de DNA do gene sendo transcrito.
RNA polimerases são grandes complexos enzimáticos compostos de muitas subunidades. Existem diferentes tipos:
- RNA polimerase I (Pol I): que transcreve os genes que codificam a subunidade ribossomal "grande".
- RNA polimerase II (Pol II): que transcreve os genes que codificam proteínas e produzem micro RNAs.
- RNA polimerase III (Pol III): que produz os RNAs de transferência usados durante a tradução e também o RNA correspondente à pequena subunidade do ribossomo.
- RNA polimerase IV e V (Pol IV e Pol V): são típicos de plantas e são responsáveis pela transcrição de pequenos RNAs interferentes.
- Qual é o processo?
Transcrição de genes eucarióticos (Fonte: Erinp.5000 / CC BY-SA (https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0) via Wikimedia Commons)
A transcrição genética é um processo que pode ser estudado dividido em três fases: iniciação, alongamento e término.
Iniciação
Durante a iniciação, a região promotora da região promotora do gene funciona como um local de reconhecimento para a RNA polimerase. É aqui que a maior parte da expressão genética é controlada
A RNA polimerase (digamos, a RNA polimerase II) se liga à sequência da região promotora, que consiste em um trecho de 6-10 pares de bases na extremidade 5 'do gene, geralmente a cerca de 35 pares de bases de distância do site de início da transcrição.
A união da RNA polimerase leva à "abertura" da dupla hélice do DNA, separando as fitas complementares. A síntese de RNA começa no local conhecido como "local de iniciação" e ocorre na direção 5'-3 ', ou seja, "a jusante" ou da esquerda para a direita (por convenção).
A iniciação da transcrição mediada por RNA polimerases depende da presença concomitante de fatores de transcrição proteica conhecidos como fatores gerais de transcrição, que contribuem para a "localização" da enzima na região promotora.
Depois que a enzima começa a polimerizar, ela é "liberada" tanto da sequência do promotor quanto dos fatores gerais de transcrição.
Alongamento
Durante o alongamento, a RNA polimerase desliza para baixo na cadeia que serve como um modelo
Ela ocorre quando a RNA polimerase "se move" ao longo da sequência de DNA e adiciona ribonucleotídeos complementares à fita de DNA que serve como um "molde" para o RNA em crescimento. Conforme a RNA polimerase "passa" pela fita de DNA, ela se reúne à sua fita antisense.
A polimerização realizada pela RNA polimerase consiste em ataques nucleofílicos de oxigênio na posição 3 'da cadeia crescente de RNA ao fosfato "alfa" do próximo precursor de nucleotídeo a ser adicionado, com a conseqüente formação de ligações fosfodiéster e liberação de um molécula de pirofosfato (PPi).
O conjunto formado pela fita de DNA, a RNA polimerase e a fita nascente de RNA é conhecido como bolha ou complexo de transcrição.
Terminação
Quando o RNA polimerase atinge a região terminal do gene, o RNA mensageiro transcricional está completo. Em seguida, RNA polimerase, fita de DNA e RNA mensageiro da transcrição se dissociam
A terminação ocorre quando a polimerase atinge a sequência de terminação, que está logicamente localizada "a jusante" do local de iniciação da transcrição. Quando isso ocorre, tanto a enzima quanto o RNA sintetizado se "destacam" da sequência de DNA que está sendo transcrita.
A região de terminação normalmente consiste em uma sequência de DNA que é capaz de se "dobrar" sobre si mesma, formando uma estrutura do tipo "hairpin loop".
Após a terminação, a fita de RNA sintetizada é conhecida como o transcrito primário, que é liberado do complexo de transcrição, após o qual pode ou não ser processado pós-transcricionalmente (antes de sua tradução em proteína, se aplicável) através de um processo denominado "corte e emenda".
Transcrição em procariontes (processo)
Uma vez que as células procarióticas não têm um núcleo envolvido por membrana, a transcrição ocorre no citosol, especificamente na região "nuclear", onde o DNA cromossômico está concentrado (as bactérias têm um cromossomo circular).
Dessa forma, o aumento da concentração citosólica de uma determinada proteína é substancialmente mais rápido em procariotos do que em eucariotos, uma vez que os processos de transcrição e tradução ocorrem no mesmo compartimento.
- Como são os genes procarióticos?
Os organismos procarióticos têm genes muito semelhantes aos eucariotos: os primeiros também fazem uso de regiões promotoras e reguladoras para sua transcrição, embora uma diferença importante tenha a ver com o fato de a região promotora muitas vezes ser suficiente para atingir uma expressão "forte" do genes.
Nesse sentido, é importante mencionar que, em geral, os genes procarióticos estão sempre "ligados" por padrão.
A região promotora está associada a outra região, geralmente "a montante", que é regulada por moléculas repressoras e é conhecida como "região operadora".
Representação da estrutura de um gene procariótico (Fonte: Thomas Shafee / CC BY (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0) via Wikimedia Commons)
Uma diferença na transcrição entre procariotos e eucariotos é que normalmente os RNAs mensageiros dos eucariotos são monocistrônicos, ou seja, cada um contém a informação para sintetizar uma única proteína, enquanto nos procariotos estes podem ser monocistrônicos ou policistrônicos, onde um único MRNA pode conter as informações para duas ou mais proteínas.
Assim, é bem conhecido que genes procarióticos que codificam proteínas com funções metabólicas semelhantes, por exemplo, são encontrados em grupos conhecidos como operons, que são simultaneamente transcritos em uma única forma de molécula de RNA mensageiro.
Os genes procarióticos são densamente compactados, sem muitas regiões não codificantes entre eles, então, uma vez transcritos em moléculas de RNA mensageiro linear, eles podem ser traduzidos em proteína imediatamente (mRNAs eucarióticos frequentemente precisam de processamento adicional).
- Como é a RNA polimerase procariótica?
Organismos procarióticos como bactérias, por exemplo, usam a mesma enzima RNA polimerase para transcrever todos os seus genes, ou seja, aqueles que codificam para subunidades ribossômicas e aqueles que codificam para diferentes proteínas celulares.
Na bactéria E. coli, a RNA polimerase é composta por 5 subunidades polipeptídicas, duas das quais são idênticas. As subunidades α, α, β, β 'compreendem a porção central da enzima e se montam e desmontam durante cada evento de transcrição.
As subunidades α são aquelas que permitem a união entre o DNA e a enzima; a subunidade β liga-se aos ribonucleotídeos trifosfato que serão polimerizados de acordo com o molde de DNA na molécula de mRNA nascente e a subunidade β 'se liga ao referido filamento de DNA molde.
A quinta subunidade, conhecida como σ participa do início da transcrição e é aquela que confere especificidade à polimerase.
- Qual é o processo?
A transcrição em procariotos é muito semelhante à de eucariotos (também é dividida em iniciação, alongamento e terminação), com algumas diferenças na identidade das regiões promotoras e os fatores de transcrição necessários para a RNA polimerase exercer suas funções.
Embora as regiões promotoras possam variar entre diferentes espécies procarióticas, existem duas sequências de "consenso" conservadas que podem ser facilmente identificadas na região -10 (TATAAT) e na região -35 (TTGACA) a montante da sequência de codificação.
Iniciação
Depende da subunidade σ da RNA polimerase, pois medeia a interação entre o DNA e a enzima, tornando-a capaz de reconhecer sequências promotoras. A iniciação termina quando alguns transcritos abortivos de cerca de 10 nucleotídeos são produzidos e liberados.
Alongamento
Quando a subunidade σ é separada da enzima, começa a fase de alongamento, que consiste na síntese de uma molécula de mRNA na direção 5'-3 '(aproximadamente 40 nucleotídeos por segundo).
Terminação
A terminação em procariotos depende de dois tipos diferentes de sinais, pode ser Rho-dependente e Rho-independente.
A proteína dependente de Rho é controlada por esta proteína que "segue" a polimerase à medida que avança na síntese de RNA até que esta obtenha uma sequência rica em guaninas (G), para e entra em contato com a proteína Rho. dissociando de DNA e mRNA.
A terminação independente de Rho é controlada por sequências específicas do gene, geralmente ricas em repetições de guanina-citosina (GC).
Referências
- Alberts, B., Johnson, A., Lewis, J., Raff, M., Roberts, K., & Walter, P. (2007). Biologia molecular da célula. Garland Science. Nova York, 1392.
- Griffiths, AJ, Wessler, SR, Lewontin, RC, Gelbart, WM, Suzuki, DT, & Miller, JH (2005). Uma introdução à análise genética. Macmillan.
- Lodish, H., Berk, A., Kaiser, CA, Krieger, M., Scott, MP, Bretscher, A.,… & Matsudaira, P. (2008). Biologia celular molecular. Macmillan.
- Nelson, DL, Lehninger, AL, & Cox, MM (2008). Princípios de bioquímica de Lehninger. Macmillan.
- Rosenberg, LE e Rosenberg, DD (2012). Genes e Genomas Humanos: Ciência. Saúde, Sociedade, 317-338.
- Shafee, T., & Lowe, R. (2017). Estrutura dos genes eucarióticos e procarióticos. Wiki Journal of Medicine, 4 (1), 2.
- McGraw-Hill Animations, youtube.com. Transcrição e tradução de DNA.